El Directorio de la Liga Chilena contra la Epilepsia está conformado por un grupo de 12 voluntarios y voluntarias, que son elegidos por un período de 3 años, mediante una votación que se realiza entre los socios de la institución, en el marco de la asamblea anual.

El rol del directorio es fundamental en la toma de decisiones institucionales. Además, cada uno de ellos tiene un vínculo específico con las distintas áreas de la Liga Chilena contra la Epilepsia, al formar parte de las comisiones de trabajo e investigación que existen en la organización.